По благословению епископа Гомельского и Жлобинского Аристарха Михаило-Архангельский приход был зарегистрирован 5 февраля 1993 года решением Гомельского областного исполнительного комитета.
Освящение места для строительства храма состоялось 13 августа 1996 года благочинным храмов Гомельского городского округа протоиереем Стефаном Гладыщуком и настоятелем прихода иереем Андреем Семеняко. Финансовую поддержку при разработке проекта и начальное строительство храма оказали Гомельский стекольный завод им. Ломоносова и ОАО "Гомельтранснефть Дружба".
Решением Костюковского поселкового исполнительного комитета Железнодорожного района города Гомеля от 30 сентября 2002 года приходу храма предоставлен в постоянное пользование земельный участок общей площадью 0,2176 га.
31 октября 2004 года архиепископ Гомельский Аристарх (Станкевич) совершил чин Великого освящения нижнего храма святого пророка Илии.
В 2008 году в верхнем храме Архангела Михаила установлен резной иконостас из натурального камня.
22 июня 2013 года жителем посёлка Костюковка Карабаньковым Сергеем в городе Тутаеве Ярославкой области приобретены и пожертвованы приходу храма шесть колоколов общим весом 228 кг.
20 октября 2013 года епископ Гомельский Стефан (Нещерет) возглавил Божественную литургию и совершил чин Великого освящения главного храма Архангела Михаила.